Les objectifs de la discipline dans l’Église sont de maintenir l’intégrité de l’église, de protéger du mal les innocents, de préserver l’efficacité du témoignage de l’église, d’avertir et de corriger les négligents, d’amener les coupables au salut, de réhabiliter les coupables, de ramener à un service effectif ceux qui sont réhabilités et de protéger la réputation et les ressources de l’église. Les membres de l’Église qui désobéissent à l’Alliance du caractère chrétien ou à l’Alliance de conduite chrétienne, ou qui violent volontairement et continuellement leurs vœux de membres, doivent être traités avec bienveillance mais aussi avec fermeté, selon la gravité de leurs offenses. La sainteté de cœur et de vie étant la norme du Nouveau Testament, l’Église du Nazaréen insiste sur un ministère pur et exige que ceux qui ont une accréditation en tant que membre du clergé soient orthodoxes quant à la doctrine et mènent une vie sainte. En conséquence, la discipline n’a pas une fonction punitive ou de rétribution, mais sert à atteindre ces objectifs. La détermination du statut et de la continuité de relation avec l’église dépend également du processus disciplinaire.